The Master er et drama som er satt til 50-årenes USA. Freddie (Joaquin Phoenix) har tjenestegjort i marinen under 2. verdenskrig. Han kommer hjem etter krigen sterkt preget av det han her opplevd, uten jobb og usikker på fremtiden. Han snubler over en trosbasert kult som engasjerer seg i øvelser for å fjerne følelser, ledet av den karismatiske og intellektuelle Lancaster Dodd, også kjent som “The Master” (Phillip Seymor Hoffman). Og menn som Dodd vet å dra nytte av en ung traumatisert dagdriver som Freddie.