Den fryktløse jagerpiloten Pete "Maverick" Mitchell er tilbake! Etter tretti år i tjeneste som toppilot i den amerikanske marinen, er Maverick akkurat der han ønsker å være. Han har takket nei til en karriere på bakken med høyere rang, til fordel for å sveve høyt og sprenge grenser som testpilot. Da Maverick får i oppgave å trene en ny gruppe unge Top Gun-piloter for et spesialoppdrag ingen pilot har utført tidligere, møter han samtidig spøkelser fra fortiden. En av pilotene er nemlig Bradley Bradshaw, også kalt «Rooster», sønn av Mavericks avdøde venn, Nick "Goose" Bradshaw. Maverick må nå konfrontere sin dypeste frykt, samtidig som han forbereder seg på et oppdrag som ingen pilot noensinne har sett maken til.